Este edificio se construyó en 1787 como el Cuerpo de Guardia del Bastión de Santa Elena, una importante batería encargada de defender la entrada al puerto. Dos de los cañones disparados contra la escuadra americana el 12 de mayo de 1898 se ven detrás del edificio. Aunque la vacuna contra la viruela (smallpox) se desarrolló durante el siglo 18 y la vacunación en la isla comenzó temprano en el siglo 19, los esfuerzos no fueron consistentes y hubo varias epidemias. El gobierno militar realizó durante la primera mitad de 1899 una intensa y efectiva campaña contra la enfermedad, estas casetas y el edificio funcionaron como centro de cuarentena para tratar y aislar a los enfermos encontrados en San Juan. Los españoles tenían un hospital para pacientes de viruela cerca del Cuartel de Ballajá, donde hoy se encuentra el Instituto de Neurobiología.
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